1996年9月,施凤堂、彭心安与市委组织部陈永红合作撰写的《外商投资企业党组织建设的实践与思考》荣获精神文明建设“五个一工程”第五届“入选作品奖”。
1997年9月,周明伟《台湾在东南亚投资分析》获得“安子介国际贸易研究奖”。
1997年10月16日,被中央党校函授学院授予“优秀学区”称号。
1998年7月,举办厦门党校系统首次教学竞赛。
1998年8月,市委决定市委副书记陈维钦兼任校(院)务委员会主任、校(院)长,朱亚衍不再兼任。
1998年9月,经国家新闻出版署批准,《特区论坛》更名为《特区党校学报》,是国内公开发行的综合性理论双月刊。
1998年9月,方和荣获“全国优秀教师”称号。
1998年10月,开始承办全国扶贫班和全国部分欠发达地区领导干部研讨班(至2001年1月,共承办9-11期全国扶贫班和12-18期全国部分欠发达地区领导干部研讨班)。
1999年11月,选派4位教师参加全省党校系统首届教学观摩比赛,其中尹彦获一等奖,方和荣、彭心安获二等奖,杨立茂获三等奖。
2000年6月8日,中央党校卫星远程教学系统厦门站建成开通,“在厦门上中央党校”成为现实。