1991年8月，市委决定市委书记兼任市委党校校长。

　　1992年9月，从本年开始至1993年，连续两年招收党政干部三年制半脱产大专班。

　　1992年12月，成立财务处，撤销外经部，开办经济实体“银鹭经济文化开发中心”。

　　1993年4月，经市委批准，改为校委会领导体制，成立校务委员会。林志渥任校务委员会副主任、常务副校长。

　　1993年9月，承办中央党校函授学院在厦门地区函授教育业务，至1995年，共招收93级、94级、95级三个年级函授班学生。

　　1993年10月，“银鹭经济文化开发中心”办理注销登记注册手续。

　　1993年12月，围绕学习贯彻十三大、十四大精神和《邓小平文选》第三卷，举办全市干部专题轮训班。

　　1994年2月，中央编制委员会批准厦门市为副省级城市，市委党校升格为副省级城市党校。

　　1994年4月，中央党校函授学院在厦门成立学区，为此，党校成立函授部，同时撤销培训部，学员管理职责由教务处承担。

　　1994年4月，与福建省社会科学院合作，参与《中国国情丛书——百县市经济社会调查（厦门卷）》的调研、写作工作。

　　1995年1月，进行机构调整，撤销哲学教研室、科学社会主义教研室、政治经济学教研室、党史党建教研室、经济管理教研室、文史教研室，成立政治教研部、经济教研部、管理教研部，加上原有办公室、政治处、教务处、行政处、财务处、函授部、图书资料室、函授部和理论研究室，内设机构共11个处室。

　　1995年5月，组织人员集体编写《青年干部政治理论培训教材》，该书由厦门大学出版社出版。

　　1995年9月，市委整合全市干部教育培训资源，决定市干部学校并入市委党校，实行市委党校、市行政学院“两块牌子、一套机构”办学，形成党校与行政学院统一办学格局。市委副书记朱亚衍任市委党校（市行政学院）校（院）务委员会主任、校（院）长。林志渥任校（院）务委员会副主任、常务副校（院）长。市委组织部副部长陈恭椿、市人事局局长蔡谋兼任副校（院）长。经批准，市委党校（市行政学院）增设行政管理教研部、学员管理处、科研处、电教中心。原管理教研部更名为基础教研部，图书资料室更名为图书资料情报中心，行政处更名为总务处。

　　1995年10月，校刊由《特区党校论坛》改名为《特区论坛》。设立科研处。建成学员活动中心。